An der Spitze des Verkehrsverein Paderborn steht ein ehrenamtlicher Vorstand, der von der Mitgliederversammlung für jeweils drei Jahre (zuletzt 2022) gewählt wird. Ihm steht ein Beirat mit beratender Funktion zur Seite. Das operative Geschäft verantwortet Karl Heinz Schäfer.

Dem Vorstand gehören laut der Wahl in der Mitgliederversammlung 2022 an:

Dietrich Honervogt (Vorsitzender)
Martin Pantke
Uwe Seibel (stellv. Vorsitzender)
Christian Stork
Anja Veith (stellv. Vorsitzende)
sowie Bürgermeister Michael Dreier als  "geborenes" Mitglied.

Den Beirat bilden: 

Heiko Appelbaum
Jürgen Behlke
Anja Jürgens
Ralf Pahlsmeier
Jochen Viehoff

Mit der Geschäftsführung betraut ist:

Karl Heinz Schäfer (Geschäftsführer)